AWS, 공개 유전체 처리부터 자연어 질의까지 연결하는 참조 코드 공개

AWS가 공개 유전체 데이터를 가져와 내성 유전자를 탐지하고 자연어로 조회하는 참조 아키텍처와 코드를 공개했다. HealthOmics의 분석 결과를 Iceberg에 저장하고 AgentCore의 에이전트가 Athena로 조회한다. AWS CDK로 배포하는 시연용 구성으로, 임상 시스템이나 고객 적용 사례는 아니다.

내용·출처 업데이트 · 2026. 10. 12. 오후 11:41

원시 시퀀싱 데이터를 가져와 fastp 품질 관리, SKESA 조립, AMRFinderPlus 유전자 탐지를 하나의 Nextflow 워크플로로 실행한다.

DynamoDB에 처리한 시료를 기록해 반복 제출의 불필요한 연산을 건너뛴다.

HealthOmics 작업에는 인터넷 접근이 없어 탐지용 참조 데이터베이스를 컨테이너 이미지에 포함한다.

Strands 에이전트는 Claude Opus 4.7을 사용하며, 답변에 유전자 ID·탐지 도구·데이터의 신뢰도 값을 포함하도록 구성했다.

HealthOmics 실행·Glue 작업·에이전트 호출에 따라 비용이 발생하며 모델 제공 여부는 AWS 리전에 따라 다르다.

같은 시료를 재처리하면 기존 행을 갱신하도록 설계해, 정기 수집과 수동 제출이 겹칠 때 결과 중복을 줄인다.